| Дата | Место проведения | |||
|---|---|---|---|---|
| 1/8 финала | ||||
| 10.05.2009 | «Восток» Целинное | 0:5 | «Спартак» Горно-Алтайск | |
| 17.05.2009 | «Динамо» Бийск | 2:0 | «Ника» Бийск | |
| 10.05.2009 | «Урожай» Кытманово | 3:0 | «Горизонт-1991» Барнаул | |
| 10.05.2009 | «Смена» Ребриха | 3:0 | «Спартак» Камень-на-Оби | |
| 10.05.2009 | «Урожай» Михайловское | +:- | «Горняк» Горняк | |
| 10.05.2009 | «Урожай» Родино | 1:2 | «Химик-Арсал» Яровое | |
| 09.05.2009 | «Юность-Элеватор» Ключи | 7:1 | «Локомотив» Кулунда | |
| 16.05.2009 | «Барнаул» Барнаул | 8:0 | «Арагац» Барнаул | |
| 1/4 финала | ||||
| 04.06.2009 | «Спартак» Горно-Алтайск | 1:3 | «Динамо» Бийск | |
| 17.05.2009 | «Смена» Ребриха | 4:0 | «Урожай» Кытманово | |
| 23.05.2009 | «Урожай» Михайловское | 1:2 | «Химик-Арсал» Яровое | |
| 07.06.2009 | «Барнаул» Барнаул | 7:0 | «Юность-Элеватор» Ключи | |
| 1/2 финала | ||||
| 18.06.2009 | «Смена» Ребриха | 0:5 | «Динамо» Бийск | |
| 20.06.2009 | «Химик-Арсал» Яровое | 1:3 | «Барнаул» Барнаул | |
| Финал | ||||
| 08.08.2009 | «Динамо» Бийск | 2:1 | «Барнаул» Барнаул | |
